Kendrick 0.15

24 mars 2015

La nouvelle version de Kendrick, dont nous avions déjà parlé, est maintenant disponible!

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L’Ebola et Smalltalk

17 décembre 2014

Pendant qu’on n’en parle pas, l’Ebola continue ses ravages : 6841 décès et 18464 personnes contaminées en date d’aujourd’hui…

Dans un effort de la communauté internationale de cerner le problème, plusieurs projets de simulation et de modélisation de la propagation ont débuté…

Smalltalk et Pharo se sont également mis à la tâche avec Kendrick, un outil de modélisation épidémiologique mathématique basé sur Moose, Roassal et PetitParser (Moose4Ebola).


Bio-informatique

20 juillet 2013

Je vous parlais, en début d’année, de BioSmalltalk (une librairie d’outils pour la bio-informatique écrite en Smalltalk disponible sur Pharo et Squeak).

Sachez que les auteurs (Hernán F. Morales et Guillermo Giovambattista) publieront un article (en anglais) dans le Bioinformatics Journal (de la prestigieuse Université d’Oxford).  Le sysnopsis de cet article est disponible ici.

Sur la même thématique, il se passe de belles choses à l’Université de Montréal en génomique et en épidémiologie au laboratoire de recherche Philip Awadalla pour le projet CARTaGENE.  Vous trouverez ici un article expliquant quels ont été les motifs qui ont poussé le laboratoire de recherche à utiliser MySQL et à préférer le moteur de stockage TokuDB à MyISAM quand est venu le temps de traiter des milliards de mutations dans leur base de données de façon performante.